Acest anime are loc în anul 2020, cu o poveste nouă avându-l în centru pe Taichi Yagami, elev în clasa a 5-a. Partenerul său e Agumon. Povestea începe în Tokyo, cu o defecțiune la scară largă a rețelei metropolitane. Taichi se pregătește pentru excursia de vară din weekend, când are loc acest incident. Mama și sora mai mică a lui Taichi sunt prinse într-un tren ce nu mai poate fi oprit, iar Taichi merge în Shibuya ca să le ajute. Pe drum însă întâlnește un fenomen ciudat ce-l duce în Lumea Digitală, împreună cu alți copii predestinați.